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来自远古的讯息(Telostmauscrits)

    冬日的暖yAn穿过研究室的窗户照到玛修背上,无视室外零下十二度低温的事实蒸着微微暖意。玛修左手食指轻敲上午刚刚送来的y碟外包装,右手食指蜷曲着用第二节指节撑着颧骨末端,右手拇指则g住他外扩的下颔。他盯着眼前的双萤幕,因为一再出现的一组数字微微皱起眉头。

    y碟里的资料是他先前委托外包厂商,进行斑马鱼基因定序的成果。因为基因样本量很少,厂商会先将原本的DNA样本用酶切断、进行聚合酶链式反应PCR後才定出序列。因此玛修收到的资料是数万,甚至数百万串不等长、由代表不同硷基对的字母排列而成的字串。他必须将这些零碎的字串b对拼贴,最後现出序列原本的样貌。

    不过这并不是让他皱眉的原因。定序的技术和重组字串的方法已经非常成熟了。像斑马鱼这种被研究透彻的模式动物,要出大纰漏并不容易。

    让他感到担忧的事情是斑马鱼粒线TMitodrion的基因序列长度和线虫的一模一样。

    当然不是指原始序列本身的长度一模一样。相较於细胞核的基因序列,粒线T的基因序列突变得更快,而且突变速率稳定,时常被用来评估生物的演化进程以及物种间的亲缘关系。线虫和斑马鱼两种生物天差地远,牠们粒线T的基因序列自然不同。

    问题出在玛修手边的理论。他正在研究粒线T基因序列的突变与演化。如果粒线T的内共生假说──我们的真核生物祖先在二十亿年前收服了一种原核生物当「小弟」──是正确的,那麽现在所有生物的粒线T硷基排列应该都源自同一条序列。由此,玛修和他的导师正着手建构一种演算法,希望能直接从生